Исследование изменений конфигурации белков с использованием глубокого обучения и биофизического моделирования.

 A Study on Protein Conformational Changes Using a Large-Scale Biophysical Sampling Augmented Deep Learning Strategy

Предсказание конформационных изменений белков

Предсказание изменений формы белков является важной задачей в области вычислительной биологии и искусственного интеллекта. Хотя достижения в области глубокого обучения, такие как AlphaFold2, помогли в предсказании статических структур, они не решают вопрос динамических изменений, которые белки испытывают для выполнения своих биологических функций.

Проблемы существующих моделей

Существующие модели, такие как анализ нормальных мод на основе эластичных сетей и гибридные модели, не способны учитывать сложные изменения в больших белках. Новые подходы на основе глубокого обучения, такие как автоэнкодеры и диффузионные модели, также сталкиваются с трудностями из-за высоких требований к данным и вычислительным затратам.

Инновационная стратегия PATHpre

Предложенная стратегия PATHpre использует биофизическую выборку для создания библиотеки из 2635 белков с экспериментально определенными состояниями. Этот подход позволяет предсказывать структурные пути, ведущие к конформационным изменениям, с высокой точностью.

Преимущества и результаты

Модель PATHpre демонстрирует отличные результаты, показывая сильные корреляции с экспериментальными данными и способствуя точному предсказанию переходных путей. Она подходит для белков с различной длиной последовательностей и сложностью структур.

Применение искусственного интеллекта

Данная работа представляет собой значительный шаг вперед в моделировании белков с помощью ИИ, предлагая эффективный и масштабируемый подход к предсказанию конформационных изменений. PATHpre станет мощным инструментом для изучения динамического поведения белков в различных контекстах — от разработки лекарств до синтетической биологии.

Как ваша компания может использовать ИИ

Чтобы использовать ИИ для развития вашей компании, нужно:

  • Анализировать, как ИИ может изменить вашу работу.
  • Определить области для автоматизации, извлекая выгоду для клиентов.
  • Измерять ключевые показатели эффективности (KPI), которые вы хотите улучшить с помощью ИИ.
  • Постепенно внедрять решения, начиная с небольших проектов и анализируя результаты.

Получить советы и попробовать решения

Если вам нужны советы по внедрению ИИ, свяжитесь с нами. Мы предлагаем ИИ-ассистенты, которые помогают в продажах, отвечая на вопросы клиентов и генерируя контент.

Мобильная разработка на заказ и готовые решения

Мобильная разработка

Готовые и индивидуальные решения

Веб решения - разработка сайтов и сервисов

Web решения

Получите бесплатную консультацию по веб-разработке прямо сейчас

Аутсорсинг, подбор специалистов и команд разработки

Аутсорсинг

Выберите своего специалиста сегодня и начните свой проект