Практическое руководство по использованию глубокого обучения в проектировании белков

 DL4Proteins Notebook Series Bridging Machine Learning and Protein Engineering: A Practical Guide to Deep Learning Tools for Protein Design

Дизайн и предсказание белков: практические решения и ценность

Дизайн и предсказание белков играют важную роль в синтетической биологии и терапии. Несмотря на успехи в области глубокого обучения, существует нехватка доступных образовательных ресурсов, которые объединяют основные концепции машинного обучения с методами инженерии белков. Это затрудняет понимание и применение этих технологий.

DL4Proteins: доступные инструменты для обучения

Серия ноутбуков DL4Proteins разработана исследователями Graylab для того, чтобы сделать глубокое обучение в дизайне и предсказании белков доступным для широкой аудитории. Эти ресурсы предлагают практические введения в инструменты, такие как AlphaFold и ProteinMPNN, и направлены на исследователей, преподавателей и студентов.

Основные ноутбуки и их ценность

  • Нейронные сети с NumPy: вводит в основы нейронных сетей и показывает, как их реализовать с помощью NumPy. Идеально подходит для начинающих.
  • Нейронные сети с PyTorch: упрощает создание нейронных сетей, используя высокоуровневые абстракции PyTorch.
  • Сверточные нейронные сети (CNN): объясняет, как CNN обрабатывают данные, подобные изображениям, и демонстрирует их применение.
  • Языковые модели для Шекспира и белков: исследует использование языковых моделей для понимания последовательностей, таких как текст и белки.
  • Языковые модели и перенос обучения: показывает, как использовать эмбеддинги языковых моделей для решения реальных задач.
  • Введение в AlphaFold: доступный обзор AlphaFold, инструмента для предсказания структуры белков.
  • Графовые нейронные сети для белков: объясняет, как графовые нейронные сети моделируют сложные отношения между аминокислотами.
  • Модели диффузии: исследует применение диффузионных моделей в предсказании структуры белков.
  • Дизайн белков: объединяет инструменты, такие как RFdiffusion и AlphaFold, для полного процесса дизайна белков.

Заключение

Интеграция инструментов глубокого обучения с дизайном и предсказанием белков имеет огромный потенциал для развития синтетической биологии и терапии. Ноутбуки DL4Proteins предлагают практические ресурсы для понимания и применения передовых технологий.

Как внедрить ИИ в вашу компанию

Если вы хотите, чтобы ваша компания развивалась с помощью ИИ, следуйте этим шагам:

  • Проанализируйте, как ИИ может изменить вашу работу.
  • Определите ключевые показатели эффективности (KPI), которые хотите улучшить с помощью ИИ.
  • Подберите подходящее решение из множества доступных вариантов ИИ.
  • Внедряйте решения постепенно, начиная с малого проекта.
  • На основе полученных данных расширяйте автоматизацию.

Если вам нужны советы по внедрению ИИ, пишите нам.

Попробуйте ИИ ассистент в продажах, который помогает отвечать на вопросы клиентов и генерировать контент для отдела продаж.

Узнайте, как ИИ может изменить ваши процессы с решениями от Flycode.ru.

Мобильная разработка на заказ и готовые решения

Мобильная разработка

Готовые и индивидуальные решения

Веб решения - разработка сайтов и сервисов

Web решения

Получите бесплатную консультацию по веб-разработке прямо сейчас

Аутсорсинг, подбор специалистов и команд разработки

Аутсорсинг

Выберите своего специалиста сегодня и начните свой проект