“`html
Продвижение точной терапии для фьюжн-онкопротеинов с помощью усовершенствованного моделирования белкового языка FusOn-pLM
Белковые фьюзионные онкопротеины, образованные хромосомными транслокациями, играют важную роль в развитии многих видов рака, особенно детских. Однако их сложные структуры и отсутствие четких участков связывания затрудняют разработку лекарств. Стандартные методы разработки препаратов часто неэффективны из-за необходимости большей специфичности или связывания с важными белками клетки.
Модель FusOn-pLM
Исследователи из Университета Дьюка разработали новую модель белкового языка FusOn-pLM, специально настроенную для фьюжн-онкопротеинов. Эта модель улучшает представление фьюзионных онкопротеинов, превзойдя базовую модель ESM-2 и другие использовавшиеся методы, и направлена на разработку терапевтических подходов к этим сложным мишеням.
Для обучения FusOn-pLM был составлен тщательно отобранный набор данных из баз данных FusionPDB и FOdb, содержащий более 45 000 последовательностей фьюзионных онкопротеинов. Методы визуализации показали, что embeddings FusOn-pLM отчетливо отделяют фьюзионные онкопротеины от их компонентов, а значит, отражают их уникальные характеристики и биологическую значимость.
Практическое применение FusOn-pLM
Модель FusOn-pLM демонстрирует превосходную производительность в предсказании поведения и свойств фьюзионных онкопротеинов, а также в их месторасположении в клетке. Это представляет значительный прорыв в биотехнологиях для лечения рака, и представляет значительное развитие в области лечения рака, вызванного фьюжн-онкопротеинами.
Для получения дополнительной информации, вы можете посмотреть статью и модель, теперь доступную для общественности.
“`
