“`html
µFormer: Deep Learning Framework for Efficient Protein Fitness Prediction and Optimization
µFormer – это глубокая модель, которая предсказывает приспособленность измененных белковых последовательностей. Она работает в два этапа: сначала предварительное обучение маскированной модели языка белков (PLM) на большом наборе неразмеченных белковых последовательностей, а затем предсказание оценок приспособленности с использованием трех интегрированных в предварительно обученную модель модулей оценки. Эти модули – уровня остатков, уровня мотивов и уровня последовательности – захватывают различные аспекты белковой последовательности и объединяют их результаты для генерации окончательной оценки приспособленности.
Особенности µFormer:
- Предсказывает высокоуровневые мутации и эпистаз, обеспечивая сильные корреляции для многопозиционных мутаций.
- Сочетает в себе глубокую модель языка белков с обучением с подкреплением для эффективного исследования пространства возможных мутаций.
- Превзошел десять методов в бенчмарке ProteinGym, достигнув средней корреляции Спирмена 0,703.
- Показал свою способность оптимизировать активность ферментов, особенно в предсказании вариантов TEM-1 против цефотаксима.
Применение µFormer:
µFormer может быть использован для прогнозирования фитнеса измененных белковых последовательностей, оптимизации эффективности ферментов и обобщения свойств белков. Он демонстрирует выдающуюся производительность в задачах прогнозирования фитнеса, включая сложные мутации и эпистаз, а также способен оптимизировать активность ферментов.
Практическое применение:
Используйте µFormer для повышения эффективности белковых инженерных решений, оптимизации дизайна белков и прогнозирования активности ферментов. Его применение может привести к значительному увеличению скорости роста бактерий и улучшению катализаторной активности.
Внедрение ИИ решений:
Если вы хотите внедрить ИИ в свой бизнес, начните с малых проектов, анализируйте результаты и постепенно расширяйте автоматизацию. Обратитесь к нам, если вам нужны советы по внедрению ИИ или хотите узнать больше о том, как ИИ может изменить ваши процессы.
Решения от Flycode.ru:
Узнайте, как ИИ может изменить ваши процессы с решениями от Flycode.ru. Попробуйте ИИ ассистент в продажах, который поможет вам отвечать на вопросы клиентов, генерировать контент для отдела продаж и снижать нагрузку на первую линию.
“`
