Проблемы в разработке антител
Создание антител с высокой специфичностью и связыванием с различными терапевтическими антигенами является серьезной задачей в разработке лекарств. Существующие методы не могут эффективно генерировать области, определяющие комплементарность (CDR), ответственные за связывание с антигенами. Особенно это касается переменной области тяжелой цепи CDR3 (HCDR3).
Проблемы существующих моделей
Текущие вычислительные модели, такие как ProteinMPNN и AntiFold, используют генеративные подходы для предсказания последовательностей антител. Однако их практическое применение ограничено из-за недостаточной экспериментальной проверки. Эти модели также не могут эффективно разрабатывать несколько областей CDR для достижения специфичности к антигенам и требуют тщательно подобранных наборов данных.
Решение от Absci Bio: IgDesign
Absci Bio представляет IgDesign — новый подход на основе глубокого обучения, который решает указанные проблемы. IgDesign использует контекстные данные, такие как последовательности антигенов и последовательности антительных каркасов (FWR), для создания оптимизированных CDR3 (HCDR3) и полных CDR тяжелой цепи (HCDR123).
Преимущества IgDesign
- Высокая точность и возможность масштабирования.
- Подтвержденная эффективность через обширные in vitro испытания.
- Способность создавать антитела с высокой аффинностью.
Процесс разработки антител
Исследователи собрали наборы данных, исключив вероятность утечки данных. Модель была предварительно обучена на общем наборе данных о белках и затем дообучена на комплексах антител и антигенов. Последовательности антител генерировались последовательно для поддержания согласованности.
Результаты
IgDesign показал превосходные результаты при разработке антител для различных антигенов. Эксперименты показали, что новые HCDR3 имели значительно более высокие показатели связывания по сравнению с базовыми значениями для семи из восьми протестированных антигенов.
Значение IgDesign для разработки лекарств
IgDesign сочетает высокую вычислительную точность с эмпирическими данными, создавая единый, упрощенный процесс. Это достижение преодолевает основные препятствия в разработке лекарств и открывает новые возможности для создания терапевтических антител.
Как искусственный интеллект может помочь вашему бизнесу
Если вы хотите, чтобы ваша компания развивалась с помощью ИИ, рассмотрите внедрение решений, подобных IgDesign. Проанализируйте, как ИИ может изменить вашу работу, определите ключевые показатели эффективности (KPI), которые вы хотите улучшить.
Пошаговый подход к внедрению ИИ
- Начните с малого проекта и анализируйте результаты.
- Расширяйте автоматизацию на основе полученных данных и опыта.
Получите помощь
Если вам нужны советы по внедрению ИИ, пишите нам.
Попробуйте ИИ ассистента в продажах, который помогает отвечать на вопросы клиентов и генерировать контент для отдела продаж. Узнайте, как ИИ может изменить ваши процессы с решениями от Flycode.ru.